Las placas de fondo plano se pueden utilizar para todos los tipos de células, pero cuando el número de células es pequeño, como para la clonación, se utiliza una placa de 96 pocillos.
Además, las placas de fondo plano se usan generalmente para MTT y otros experimentos, tanto para celdas suspendidas como con paredes.
Las placas U o V se utilizan generalmente para requisitos específicos.Por ejemplo, en inmunología, cuando se mezclan dos linfocitos diferentes, necesitan estar en contacto entre sí para estimularse.Por lo tanto, generalmente se requieren placas en U ya que las células se acumularán en un área pequeña debido a la gravedad.Las placas V se usan con mucha menos frecuencia para experimentos de destrucción de células para que las células objetivo entren en contacto cercano, pero también pueden reemplazarse por placas U (después de agregar las células, centrifugar a baja velocidad).
Para el cultivo celular se suelen utilizar placas de fondo plano, con especial atención al material.
Los de fondo redondo se suelen utilizar para análisis, reacciones químicas o almacenamiento de muestras.Esto se debe a que el fondo redondo es mejor para limpiar el líquido, a diferencia del fondo plano.Sin embargo, si está midiendo valores de absorbancia, siempre debe comprar uno de fondo plano.
La mayoría de las placas de cultivo celular tienen un fondo plano para facilitar la observación microscópica, un área de fondo transparente, un nivel de cultivo celular relativamente uniforme y para pruebas de MTT.
Las placas de fondo redondo se utilizan principalmente para experimentos de dopaje con isótopos en los que las células deben recolectarse con un colector de células, como "cultivos mixtos de linfocitos".